Τέλος τα Multi Split συστήματα κλιματισμού παρέχουν πλήρη αυτονομία επιλογής και λειτουργίας των εσωτερικών μονάδων. Έτσι μπορούμε να επιλέξουμε οποιονδήποτε τύπο εσωτερικής μονάδας για τον αντίστοιχο χώρο του κτιρίου μας (εσωτερικές μονάδες τύπου τοίχου, δαπέδου, οροφής, καναλάτο, κασέτας), έχοντας πλήρη αυτονομία λειτουργίας για το πόσες και ποιες εσωτερικές μονάδες θέλουμε κάθε φορά να βρίσκονται σε λειτουργία με την εξωτερική μονάδα να προσαρμόζει αυτόματα την απόδοση και την κατανάλωσή της με βάση των αριθμό και την ισχύς των εσωτερικών μονάδων που βρίσκονται ενεργοποιημένες, έχοντας ταυτόχρονα πλήρη αυτονομία επιλογής θερμοκρασίας των χώρων που θέλουμε να κλιματίσουμε.
Ο χειρισμός της κάθε εσωτερικής μονάδας επιτυγχάνεται από το κάθε χειριστήριο που ξεχωριστά διαθέτει η κάθε μία εσωτερική μονάδα.